1、生物有机肥中有大量的有益微生物，能分解土壤中的有机物，增加土壤的团粒结构，改善土壤组成。微生物在土壤中的繁殖速度非常快，他们就像一张看不见的大网，错综复杂。微生物的菌体死亡后，在土壤中留下了很多微细的管道，这些微细的管道不但增加了土壤的透气性，而且还使土壤变得蓬松柔软，养分水分不易流失，增加了土壤蓄水蓄肥能力，避免和消除了土壤的板结。　　2、有机肥中的有益微生物还能抑制有害病菌的繁殖，这样我们就可以少打农药，如果连续多年施用，可以有效抑制土壤有害生物，省工、省钱、还无污染。　　3、土壤中的微量元素95%以不溶态形式存在，不能被植物吸收利用，而微生物代谢产物中含有大量的有机酸类物质，这些物质就像在冰块中加入的热水一样，很快就能把微量元素钙、镁、硫、铜、锌、铁、硼、钼等植物必需的矿物元素溶解，变成可以被植物直接吸收利用的营养元素，大大增加了土壤的供肥能力。　　4、生物有机肥中的枯草芽孢杆菌等有益微生物利用土壤中的有机质，产生次级代谢物，其中含有大量的促生长类物质。如生长素，能促进植物伸长生长，脱落酸，能促进果实成熟，赤霉素能促进开花坐果，增加开花数、保果率，提高产量，使果实饱满，色泽鲜嫩，还能提早上市，达到增产增收。　　5、有机肥中的微生物具有很强的生命力，在土壤中长期存活，固氮菌、解磷、解钾菌等微生物，可利用空气中的氮并释放土壤中不易被作物吸收的钾和磷，持续供给作物养分。所以有机肥还具有长效性。　　6、据相关数据证实我们实际生产中化肥的利用率只有30%～45%。损失的化肥一部分分解释放到大气中，一部分则随着水土流失掉了，还有一部分被固定在土壤中，不能被植物直接吸收利用，而且还会造成土壤盐渍化和板结等不良后果。当我们施入有机肥后，其有益生物活动就能改善土壤结构，增加土壤保水保肥能力，从而减少了养分的流失。加上有机质有益微生物解磷解钾作用，能使化肥有效利用率提高到50%以上。　　7、有机肥可以增加作物产量，改善农产品质量在同等营养元素的条件下，有机肥与化肥相比较，在作基肥施用时，一般有机肥比化肥效果要好，在作追肥施用时，经过充分腐解的有机肥其效果常常也比化肥要好。尤其是提高农产品品质比化肥更为有利。我国农民有使用有机肥的传统，十分重视有机肥的使用。美国、西欧、日本等发达国家，正在兴起”生态农业””有机农业”，十分重视使用有机肥料，并把有机肥料规定为生产绿色食品的主要肥源。　　8，有机肥能促进土壤微生物生长，促进作物吸收利用 有机肥料含有大量的有机质，是各种微生物生长和繁衍的 场所。有机肥的有机物在腐熟过程中还能产生各种酚、维生素、酶、生长素及类激素等物质，促进作物根系生长和对养分的吸收。　　9、减少养分固定，提高养分的有效性 有机肥含有许多有机酸、腐植质酸及其他羟基类物质，它们都具有很强的螯合能力，能与许多金属元素螯合形成螯合物，可防止土壤对这些营养元素的固定而失效。如有机肥与磷肥掺合施用，有机肥中的有机酸等螯合物能将土壤中活性很强的铝离子螯合，可防止铝与磷结合形成作物很难吸收的闭蓄态磷，大大提高土壤有效态磷含量。　　10、加速土壤团聚体的形成，改善土壤理化性质 有机—无机团聚体是土壤肥沃的重要指标，它含量越多，土壤物理性质越好，土壤越肥沃，保土、保水、保肥能力越强，通气性能越好，越有利于作物根系生长。